Í Flataskóla er áhersla lögð á gott stuðningsnet við nemendur. Kennsla er skipulögð með ýmsum hætti til að koma til móts við ólíkar þarfir nemenda m.a.:

• Fjölbreytta kennsluhætti til að koma til móts við þarfir hvers og eins
• Færnimiðað nám í markvissri málörvun og lestri
• Lotukennsla í list- og verkgreinum
• Misstórir námshópar
• Samvinna innan árgangs og milli árganga
• Sérkennsla nemenda samkvæmt greiningu sérfræðinga og greinandi skimunarprófum, ábendingum ýmissa aðila, svo sem leikskólakennara, talmeinafræðings, kennara, deildarstjóra og foreldra.